La modalità server è un tipo di distribuzione di pgAdmin in cui l'applicazione viene eseguita come servizio accessibile via web invece che solo come strumento desktop locale. Gli utenti si connettono tramite un browser, mentre il processo di pgAdmin resta su un host che può essere condiviso, remoto o raggiungibile da Internet. In questa modalità, il servizio può centralizzare l'amministrazione dei database PostgreSQL, ma amplia anche la superficie di attacco perché le funzionalità di autenticazione, sessione e gestione dei file sono esposte attraverso una rete.
Nella sicurezza informatica, la modalità server è importante perché i difetti nel livello di gestione possono influire su più aspetti oltre alla sola interfaccia. Una vulnerabilità può consentire l'accesso non autorizzato alla console di amministrazione, la divulgazione dei dettagli di connessione salvati o l'abuso dei flussi di lavoro lato server sulla macchina che esegue pgAdmin. Chi difende dovrebbe trattare le istanze in modalità server come infrastrutture sensibili: limitare l'esposizione, imporre un'autenticazione forte, monitorare gli accessi anomali e applicare rapidamente le patch quando vengono segnalati problemi di sicurezza, soprattutto se il codice di exploit proof-of-concept è pubblico.